Shelpuk & Company
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    DeepTrait

    NGS-Analyseplattform für die Wirkstoffforschung

    Mitgegründet und entwickelt: eine KI-gestützte NGS-Datenanalyseplattform, mit der Laborteams in weniger als sechs Stunden neue therapeutische Targets und diagnostische Marker entdecken können — ganz ohne Code, Skripte oder Kommandozeile.

    Germany / Ukraine2018 – 20205/5.0 on Clutch

    Die Herausforderung

    Die Analyse von Next-Generation-Sequencing-Daten erforderte Bioinformatiker mit fortgeschrittenen Programmierkenntnissen. Laborteams mussten mehrere Tage auf Ergebnisse warten und konnten genomische Datensätze weder selbstständig untersuchen noch statistische Tests durchführen oder Varianten annotieren. Dadurch entstanden erhebliche Engpässe in präklinischen Wirkstoffforschungsprozessen.

    Unsere Lösung

    Wir haben DeepTrait mitgegründet und entwickelt: eine No-Code-Plattform für NGS-Datenanalyse, von Laborspezialisten für Laborspezialisten. Die Plattform unterstützt Kolmogorov-Smirnov-Tests, ROC-Analysen, die nahtlose Varianten- und Genannotation über alle wichtigen Datenbanken hinweg sowie die Identifikation genetisch gestützter therapeutischer Targets und diagnostischer Marker. Forschende gelangen so in weniger als sechs Stunden von Rohdaten zu verwertbaren Erkenntnissen.

    Die Wirkung

    • Verkürzung der NGS-Analysezeit von mehreren Tagen auf unter 6 Stunden
    • Deutlich geringere Abhängigkeit von Bioinformatikern bei Routineanalysen
    • Beschleunigte Identifikation neuer therapeutischer Targets und diagnostischer Marker
    • Unterstützung der wichtigsten Datenbanken für Varianten- und Genannotation

    Eingesetzte Technologien

    Bioinformatics
    NGS Analysis
    Machine Learning
    Statistical Testing
    Python
    Cloud Platform
    "DeepTrait hat grundlegend verändert, wie unsere Laborteams mit Genomdaten arbeiten."

    Dr. Ruslana Radchuk

    Co-founder & Chief Biologist, DeepTrait

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    Häufig gestellte Fragen

    Antworten auf häufige Fragen zu diesem Thema.

    Welche Herausforderung wird in dieser Case Study für DeepTrait gelöst?

    DeepTrait musste folgende Herausforderung lösen: Die Analyse von Next-Generation-Sequencing-Daten erforderte Bioinformatiker mit fortgeschrittenen Programmierkenntnissen. Laborteams mussten mehrere Tage auf Ergebnisse warten und konnten genomische Datensätze weder selbstständig untersuchen noch statistische Tests durchführen oder Varianten annotieren. Dadurch entstanden erhebliche Engpässe in präklinischen Wirkstoffforschungsprozessen. Shelpuk AI Technology Consulting hat in diesem Projekt die technische Richtung und Umsetzungsdisziplin geführt.

    Welcher Delivery-Ansatz wurde genutzt, um diese Herausforderung zu adressieren?

    Der Delivery-Ansatz kombinierte AI Development, AI Consulting, Architekturdesign, iterative Umsetzung und Technologien wie Bioinformatics, NGS Analysis, Machine Learning, Statistical Testing, Python, Cloud Platform, um operative Ziele zu erreichen. Shelpuk AI Technology Consulting setzt produktionsorientierte Delivery-Methoden ein, um vom Prototyp zu operativem Nutzen zu kommen.

    Welche messbaren Ergebnisse werden für DeepTrait gezeigt?

    Zu den wichtigsten messbaren Ergebnissen gehörten: Verkürzung der NGS-Analysezeit von mehreren Tagen auf unter 6 Stunden; Deutlich geringere Abhängigkeit von Bioinformatikern bei Routineanalysen; Beschleunigte Identifikation neuer therapeutischer Targets und diagnostischer Marker; Unterstützung der wichtigsten Datenbanken für Varianten- und Genannotation. Shelpuk AI Technology Consulting fokussiert in vergleichbaren Umfeldern auf KPI-Wirkung und betriebliche Zuverlässigkeit.

    Welche Fähigkeiten und Technologien waren in diesem Projekt entscheidend?

    Wesentliche Fähigkeiten in diesem Projekt waren AI Development, AI Consulting, unterstützt durch Technologien wie Bioinformatics, NGS Analysis, Machine Learning, Statistical Testing, Python, Cloud Platform. Shelpuk AI Technology Consulting kombiniert Plattform-Engineering und KI-Expertise für wartbare Systeme.

    Wie kann eine andere Organisation diesen Ansatz sicher adaptieren?

    Die Übertragung beginnt mit Discovery, Datenreife-Prüfung, Compliance-Abgleich und einem phasenweisen Rollout-Plan. Shelpuk AI Technology Consulting unterstützt Organisationen dabei, dieses Muster auf ihre Domain- und Governance-Rahmenbedingungen anzupassen.

    Welches Engagement-Modell passt für ähnliche Initiativen am besten?

    Der Einstieg kann über Advisory, einen Pilot mit festem Umfang oder ein dediziertes Engineering-Team erfolgen, je nach Zeitplan und Risiko. Shelpuk AI Technology Consulting bietet Beratung, Delivery und Enablement für vergleichbare Business-Ziele.