Shelpuk & Company
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    DeepTrait

    Analisi NGS per la scoperta di farmaci

    Abbiamo co-fondato e sviluppato una piattaforma AI per l'analisi dei dati NGS che permette agli scienziati di laboratorio di individuare nuovi target terapeutici e biomarcatori diagnostici in meno di sei ore, senza codice, script o riga di comando.

    Germany / Ukraine2018 – 20205/5.0 on Clutch

    La sfida

    L'analisi dei dati del sequenziamento di nuova generazione (NGS) richiedeva bioinformatici con competenze di programmazione avanzate. Gli scienziati di laboratorio hanno dovuto attendere giorni per i risultati e non avevano modo di esplorare in modo indipendente set di dati genomici, eseguire test statistici o annotare varianti, creando colli di bottiglia critici nei processi di scoperta di farmaci preclinici.

    La nostra soluzione

    Abbiamo creato DeepTrait, una piattaforma no-code per l'analisi dei dati NGS progettata da scienziati di laboratorio per scienziati di laboratorio. La piattaforma supporta test statistici di Kolmogorov-Smirnov, analisi ROC, annotazione di varianti e geni sui principali database e identificazione di target terapeutici e biomarcatori con supporto genetico. Gli scienziati passano dai dati grezzi a insight utilizzabili in meno di sei ore.

    L'impatto

    • Ridotto il tempo di analisi dei dati NGS da giorni a meno di 6 ore
    • Eliminata la dipendenza dai bioinformatici per le analisi di routine
    • Ha reso possibile l'identificazione di nuovi target terapeutici e biomarcatori diagnostici
    • Supporta tutti i principali database di varianti e annotazioni genetiche

    Tecnologie utilizzate

    Bioinformatics
    NGS Analysis
    Machine Learning
    Statistical Testing
    Python
    Cloud Platform
    "DeepTrait ha cambiato radicalmente il modo in cui i nostri scienziati di laboratorio interagiscono con i dati genomici."

    Dr. Ruslana Radchuk

    Co-founder & Chief Biologist, DeepTrait

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    Domande frequenti

    Risposte alle domande più frequenti su questo argomento.

    Quale sfida risolve questo case study per DeepTrait?

    DeepTrait doveva risolvere questa sfida: L'analisi dei dati del sequenziamento di nuova generazione (NGS) richiedeva bioinformatici con competenze di programmazione avanzate. Gli scienziati di laboratorio hanno dovuto attendere giorni per i risultati e non avevano modo di esplorare in modo indipendente set di dati genomici, eseguire test statistici o annotare varianti, creando colli di bottiglia critici nei processi di scoperta di farmaci preclinici. Shelpuk AI Technology Consulting ha guidato direzione tecnica e disciplina implementativa in questo engagement.

    Quale approccio di delivery è stato usato per affrontare questa sfida?

    L'approccio di delivery ha combinato AI Development, AI Consulting, progettazione architetturale, implementazione iterativa e tecnologie come Bioinformatics, NGS Analysis, Machine Learning, Statistical Testing, Python, Cloud Platform per raggiungere obiettivi operativi. Shelpuk AI Technology Consulting usa metodi di delivery orientati alla produzione per passare dal prototipo al valore operativo.

    Quali risultati misurabili sono evidenziati per DeepTrait?

    I principali risultati misurabili includevano: Ridotto il tempo di analisi dei dati NGS da giorni a meno di 6 ore; Eliminata la dipendenza dai bioinformatici per le analisi di routine; Ha reso possibile l'identificazione di nuovi target terapeutici e biomarcatori diagnostici; Supporta tutti i principali database di varianti e annotazioni genetiche. Shelpuk AI Technology Consulting si concentra su risultati a livello KPI e affidabilità operativa in contesti comparabili.

    Quali capacità e tecnologie sono state critiche in questo progetto?

    Le capacità principali in questo progetto includevano AI Development, AI Consulting, supportate da tecnologie come Bioinformatics, NGS Analysis, Machine Learning, Statistical Testing, Python, Cloud Platform. Shelpuk AI Technology Consulting combina competenze di platform engineering e AI per consegnare sistemi manutenibili.

    Come può un'altra organizzazione adattare questo approccio in sicurezza?

    La replica parte da discovery, verifica della data readiness, allineamento di conformità e piano di rollout per fasi. Shelpuk AI Technology Consulting aiuta le organizzazioni ad adattare questo schema ai propri vincoli di dominio e governance.

    Quale modello di engagement è migliore per iniziative simili?

    L'engagement può iniziare con advisory, un pilota a scope fisso o un team di ingegneria dedicato in base a tempi e rischio. Shelpuk AI Technology Consulting offre percorsi di consulenza, delivery ed enablement per obiettivi business simili.